Según el artículo 9 del bando municipal, el municipio de Jilotzingo está integrado por cinco pueblos, veintisiete barrios, cuatro ejidos y cuatro bienes comunales.
Los pueblos son: Santa Ana Jilotzingo, que es la cabecera municipal y está integrada por los siguientes barrios: Quishiuada, El Calvario, Damohu y Manzanitas.
Otro de los pueblos, por cierto cercano a la cabecera municipal es de origen colonial, se llama Espíritu Santo. Originalmente era un fuerte de defensa militar creado por la corona española.
Alrededor de este fuerte nacieron varios ranchos que cultivaban verduras y cereales para: la alimentación de soldados y comerciar con habitantes de pueblos cercanos.
Espíritu Santo cuenta con los siguientes barrios: Los Gallos, Daditay, Rancho Blanco, Dos Caminos, La Lomita y La Soledad.
Otro poblado cercano es San Miguel Tecpan, el cual conserva su nombre en náhuatl, que quiere decir: "Residencia real", compuesto de las raíces "tec": metaplasmo de tecutli, soberano y "pan": sobre .
San Miguel Tecpan cuenta con cuatro barrios que son: Loma, La Huerta, Jiante, El Cerro, y Endemishi.
El cuarto pueblo también de origen prehispánico, es Santa María Mazatla, Mazatla es un vocabolo náhuatl, se traduce como "donde abundan los venados".
Este pueblo está compuesto por cinco barrios que son: Las Manzanas, San José, Barrio de Abajo, Barrio de Arriba y Dongú.
El quinto y último pueblo es San Luis Ayuca, que sin duda es el pueblo más grande del municipio. Ayucan en náhuatl se traduce como "Lugar de tortugas".
San Luis Ayucan tiene seis barrios que son: Grande, Monfi, Edonica, Dongu, La cuesta, Encido.
El ayuntamiento constitucional de Jilotzingo es el órgano responsables del gobierno y administración municipal, se integra como sigue:
Un presidente municipal
Un síndico procurador
Siete regidores
Principales Comisiones del Ayuntamiento
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Pertenece al XIII Distrito Rentístico y Judicial de Tlalnepantla. Políticamente se ubica dentro del XVIII Distrito Electoral Federal con cabecera en Huixquilucan y en XLIV Distrito Electoral Local con cabecera en Nicolás Romero.